火影忍者最后的战争作为一款深度还原原著剧情的游戏，隐藏了许多需要玩家仔细探索的攻略技巧。解锁特定角色如雏田需要在晚上前往空房间反复刷取，而转生眼等级需提升至40才能触发后续剧情。白天与萨姆依对话三次并专注培养她的能力直至查克拉变化，是开启关键支线的必要条件。酒吧灌醉纲手三次可进入特殊剧情，完成后需在饭馆继续互动直至选项全部完成。装备系统方面，基地右侧的下忍装备可升级为影级，影级护鞋进一步合成疾风履需消耗22000金钱，命运宝石注入玉能附加技能效果或属性加成。
游戏中的套装系统分为白虎、青龙、朱雀、玄武四种，分别对应力量、敏捷、智力和全属性加成。白虎套装附带分裂效果，青龙套装提供吸血能力，朱雀套装具有多重攻击特性，玄武套装则强化防御属性。合成套装需要三件基础装备搭配三个相同石头，不同石头组合决定最终套装类型。雷神之剑和初级衣服可通过升级获得终极形态，而队友技能的玉可通过交换获取。查克拉管理是战斗核心，合理分配技能释放频率能显著提升持续作战能力，尤其在面对霸体状态的敌人时需保留关键技能。
角色培养方面，佐良娜的陪练剧情需在教学楼等待触发，肢体互动和内心抚慰可提升好感度。花费500进行约会后可自由见面，专攻体术训练直至全部结束能解锁隐藏能力。蝶蝶的攻略需通过送礼和白天等待佐良娜激活特殊剧情，饭店和酒吧的转生眼事件是推进关键。森林区域的进入需通关前置关卡白色噩梦，控制角色向右直行至悬崖边即可触发。纲手的霸体技能在开场和残血时发动，需避免硬拼并利用走位拖延时间。
游戏机制上，跳过学校与纲手的初期剧情可直接进入废墟章节加速流程。副本挑战不仅是等级提升途径，更能获取稀有素材用于装备进阶。战斗时注意观察敌人起手动作可预判技能范围，保持移动规避伤害比单纯防御更有效率。多人对战模式中，角色搭配需兼顾输出、控制和治疗，合理运用幻术师削弱敌人能大幅降低战斗难度。剧情任务的选择会影响后续发展，部分选项需要特定条件才会显示，反复尝试不同组合可能发现隐藏内容。
装备强化和技能升级的优先级应根据当前进度调整，过度追求单一属性可能导致后期短板。每日活动提供的奖励是资源重要来源，即使时间有限也应完成基础目标。游戏中的时间系统影响NPC出现位置，白天与夜晚分别对应不同事件触发条件。部分隐藏成就需要完成看似无关的支线任务链，保持探索心态有助于发现这些设计。战斗中的暂停功能可用于调整策略，在高难度关卡中合理规划技能冷却时间至关重要。
